Cross-correlated relaxation in NMR of macromolecules in the presence of fast and slow internal dynamics

Liliya Vugmeyster; Philippe Pelupessy; Boris E. Vugmeister; Daniel Abergel; Geoffrey Bodenhausen

doi:10.1016/j.crhy.2004.02.004

Cross-correlated relaxation in NMR of macromolecules in the presence of fast and slow internal dynamics
[Relaxation par corrélation croisée en RMN de macromolécules en présence de dynamiques internes lente et rapide]

Présenté par : Guy Laval

Liliya Vugmeyster ¹ ; Philippe Pelupessy ² ; Boris E. Vugmeister ³ ; Daniel Abergel ² ; Geoffrey Bodenhausen ^1,²

¹ Institut de chimie moléculaire et biologique, École polytechnique fédérale de Lausanne, BCH, 1015 Lausanne, Switzerland
² Département de chimie, associé au CNRS, École normale supérieure, 24, rue Lhomond, 75231 Paris cedex 05, France
³ Department of Chemistry, Princeton University, Princeton, NJ 08544, USA

Comptes Rendus. Physique, Volume 5 (2004) no. 3, pp. 377-386.

Résumé
Abstract

Dans cet article, nous présentons une analyse des fonctions de corrélation et de densité spectrale impliquées dans l'auto-relaxation et la relaxation par corrélation croisée en résonance magnétique des macromolécules. La dynamique interne d'une macromolécule est décrite par deux processus distincts de fluctuations internes respectivement lent et rapide, associés à des temps de corrélation différents. L'approche développée dans ce travail prend en compte un possible couplage entre ces deux types de mouvements internes.

In this paper we present an analysis of correlation and spectral density functions involved in autorelaxation and cross-correlated relaxation in the magnetic resonance of macromolecules. Internal dynamics of the macromolecule are described in terms of two distinct fluctuation processes with different, slow and fast, correlation times. The approach developed in this work takes into account the possible coupling between both fluctuating internal processes.

Publié le : 2004-04-01

DOI : 10.1016/j.crhy.2004.02.004

Keywords: NMR, Relaxation, Order parameter, Lipari–Szabo, Internal mobility
Mot clés : RMN, Relaxation, Paramètres d'ordre Lipari–Szabo, Mouvements internes

Affiliations des auteurs :

Liliya Vugmeyster ¹ ; Philippe Pelupessy ² ; Boris E. Vugmeister ³ ; Daniel Abergel ² ; Geoffrey Bodenhausen ^{1, 2}

¹ Institut de chimie moléculaire et biologique, École polytechnique fédérale de Lausanne, BCH, 1015 Lausanne, Switzerland
² Département de chimie, associé au CNRS, École normale supérieure, 24, rue Lhomond, 75231 Paris cedex 05, France
³ Department of Chemistry, Princeton University, Princeton, NJ 08544, USA

@article{CRPHYS_2004__5_3_377_0,
     author = {Liliya Vugmeyster and Philippe Pelupessy and Boris E. Vugmeister and Daniel Abergel and Geoffrey Bodenhausen},
     title = {Cross-correlated relaxation in {NMR} of macromolecules in the presence of fast and slow internal dynamics},
     journal = {Comptes Rendus. Physique},
     pages = {377--386},
     publisher = {Elsevier},
     volume = {5},
     number = {3},
     year = {2004},
     doi = {10.1016/j.crhy.2004.02.004},
     language = {en},
}

TY  - JOUR
AU  - Liliya Vugmeyster
AU  - Philippe Pelupessy
AU  - Boris E. Vugmeister
AU  - Daniel Abergel
AU  - Geoffrey Bodenhausen
TI  - Cross-correlated relaxation in NMR of macromolecules in the presence of fast and slow internal dynamics
JO  - Comptes Rendus. Physique
PY  - 2004
SP  - 377
EP  - 386
VL  - 5
IS  - 3
PB  - Elsevier
DO  - 10.1016/j.crhy.2004.02.004
LA  - en
ID  - CRPHYS_2004__5_3_377_0
ER  -

%0 Journal Article
%A Liliya Vugmeyster
%A Philippe Pelupessy
%A Boris E. Vugmeister
%A Daniel Abergel
%A Geoffrey Bodenhausen
%T Cross-correlated relaxation in NMR of macromolecules in the presence of fast and slow internal dynamics
%J Comptes Rendus. Physique
%D 2004
%P 377-386
%V 5
%N 3
%I Elsevier
%R 10.1016/j.crhy.2004.02.004
%G en
%F CRPHYS_2004__5_3_377_0

Liliya Vugmeyster; Philippe Pelupessy; Boris E. Vugmeister; Daniel Abergel; Geoffrey Bodenhausen. Cross-correlated relaxation in NMR of macromolecules in the presence of fast and slow internal dynamics. Comptes Rendus. Physique, Volume 5 (2004) no. 3, pp. 377-386. doi : 10.1016/j.crhy.2004.02.004. https://comptes-rendus.academie-sciences.fr/physique/articles/10.1016/j.crhy.2004.02.004/

Bibliographie
Cité par

[1] A. Kumar; R.G. Christy; P.K. Madhu Prog. NMR Spectrosc., 37 (2000), pp. 191-319

[2] D. Frueh Progr. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc., 41 (2003), pp. 305-324

[3] M. Goldman J. Magn. Reson., 60 (1984), pp. 437-452

[4] B. Brutscher Concepts Magn. Reson., 12 (2000), pp. 207-234

[5] I.C. Felli; H. Desvaux; G. Bodenhausen J. Biomol. Nucl. Magn. Reson., 12 (1998), pp. 509-521

[6] P. Pelupessy; S. Ravindranathan; G. Bodenhausen J. Biomol. Nucl. Magn. Reson., 25 (2003), pp. 265-280

[7] H. Desvaux J. Magn. Reson., 127 (1997), pp. 1-16

[8] E. Chiarparin; P. Pelupessy; R. Ghose; G. Bodenhausen J. Am. Chem. Soc., 121 (2002), pp. 6876-6883

[9] J. Dittmer; C. Kim; G. Bodenhausen J. Biomol. Nucl. Magn. Reson., 26 (2003), pp. 259-275

[10] G. Lipari; A.J. Szabo J. Amer. Chem. Soc., 104 (1982), pp. 4546-4559

[11] V.A. Daragan; K.H. Mayo Progr. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc., 32 (1997), pp. 63-105

[12] A.G. Palmer Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 30 (2001), pp. 129-155

[13] A.G. Palmer; A.J. McDermott J. Phys. Chem., 199 (1996), pp. 13293-13310

[14] L.E. Kay Nat. Struct. Biol., 7 (2000), pp. 740-743

[15] R.T. Ishima Nat. Struct. Biol., 7 (2000), pp. 740-743

[16] V. Tugarivov; Z. Liang; Yu.E. Shapiro; J.H. Freed; E. Meirovitch J. Am. Chem. Soc., 123 (2001), pp. 3055-3063

[17] L. Vugmeyster; D.P. Raleigh; A.G. Palmer; B.E. Vugmeister J. Am. Chem. Soc., 125 (2003), pp. 8400-8404

[18] M.G. Clore; A. Szabo; A. Bax; L.E. Kay; P.C. Driscoll; A.M. Gronenborn J. Am. Chem. Soc., 112 (1990), p. 4989

[19] V.A. Daragan; K.H. Mayo J. Magn. Reson., 100 (1996), pp. 8378-8388

[20] M. Deschamps; G. Bodenhausen ChemPhysChem., 2 (2002), pp. 539-543

[21] M. Deschamps J. Phys. Chem. A, 106 (2002), pp. 2438-2445

[22] V.A. Daragan; K.H. Mayo J. Phys. Chem. B, 103 (1999), pp. 6829-6834

[23] D.M. Korzhnev Progr. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc., 38 (2001), pp. 197-266

[24] S. Vijay-Kumar; C.E. Bugg; C.J. Cook J. Mol. Biol., 194 (1987), pp. 531-534

[25] G. Cornilescu; J.L. Marquardt; M. Ottiger; A. Bax J. Am. Chem. Soc., 120 (1998), pp. 6836-6837

Cité par Sources :

Commentaires - Politique