Comptes Rendus

Sommaire du Fascicule no. S1




Introductory conference: on the relevance of protected areas for the research on conservation ecology: from fundaments to applications
[Conférence introductive : intérêt des aires protégées pour la recherche en écologie de la conservation : des fondements aux applications]
p. 3-8

The relationships between taxonomy and conservation biology in the century of extinctions
[Les relations entre la taxinomie et la biologie de la conservation au siècle des extinctions]
p. 9-21

Genetics and conservation biology
[Génétique et biologie de la conservation]
p. 22-29

Implications of an individualistic lifestyle for species conservation: lessons from jealous beasts
[Implications d'un mode de vie individualiste pour la conservation des espèces : ce que nous apprennent les bêtes jalouses]
p. 30-36

Genetic diversity in European red deer (Cervus elaphus L.): anthropogenic influences on natural populations
[Diversité génétique du cerf rouge européen : influences anthropogéniques sur les populations naturelles]
p. 37-42

AFLP: a useful tool for biodiversity conservation and management
[Les AFLP : un outil efficace pour la gestion et la conservation de la biodiversité]
p. 43-48

Molecular survey of genetic diversity in the endangered European mink Mustela lutreola
[Étude moléculaire de la diversité génétique chez une espèce en danger, le vison européen, Mustela lutreola]
p. 49-53

Conservation genetics of carnivores in Italy
[La conservation génétique des carnivores en Italie]
p. 54-60

Evaluation of methodology for detection of genetic bottlenecks: inferences from temporally replicated lake trout populations
[Évaluation d'une méthode génétique de détection des goulots d'étranglement par une approche diachronique de populations de truites]
p. 61-67

Inbreeding and road effect zone in a Ranidae: the case of Agile frog, Rana dalmatina Bonaparte, 1840
[Consanguinité et zone d'impact génétique de la route chez un ranidé : le cas de la grenouille agile, Rana dalmatina Bonaparte, 1840]
p. 68-72

Phylogenetics and the conservation of a diverse and ancient flora
[Phylogénétique et conservation d'une flore diverse et ancienne]
p. 73-79

Hare populations in Europe: intra and interspecific analysis of mtDNA variation
[Les populations de lièvre en Europe : analyse des variations intra- et interspécifique de l'ADNmt]
p. 80-84

Frog alien species: a way for genetic invasion?
[Les grenouilles introduites : une voie pour l'invasion génétique ?]
p. 85-92

Applying molecular genetic tools to the conservation and action plan for the critically endangered Far Eastern leopard (Panthera pardus orientalis)
[Application des outils de génétique moléculaire à la conservation et au plan de sauvegarde d'une espèce en grave danger, le léopard d'Extrême-Orient (Panthera pardus orientalis)]
p. 93-97

Conservation of endangered species and the patterns and propensities of biodiversity
[La préservation des espèces en péril et les patterns et propensions de la biodiversité]
p. 98-103

Challenges to reestablishment of free-ranging populations of black-footed ferrets
[Les challenges de la restauration des populations sauvages de furets à pieds noirs]
p. 104-111

Research needs for lion conservation in West and Central Africa
[Les recherches nécessaires à la conservation du lion en Afrique Centrale et de l'Ouest]
p. 112-118

Count data, detection probabilities, and the demography, dynamics, distribution, and decline of amphibians
[Dénombrement, probabilités de détection et démographie, dynamique, distribution et déclin des amphibiens]
p. 119-124

Biodiversity in salt marshes: from patrimonial value to ecosystem functioning. The case study of the Mont-Saint-Michel bay
[Biodiversité dans les marais salés : de la valeur patrimoniale au fonctionnement de l'écosystème. Le cas de la baie du Mont-Saint-Michel]
p. 125-131

Habitat fragmentation and amphibian conservation: building a tool for assessing landscape matrix connectivity
[Fragmentation des habitats et conservation des amphibiens : construction d'un outil pour évaluer la connexité du paysage]
p. 132-139

Shorebird community variations indicative of a general perturbation in the Mont-Saint-Michel bay (France)
[Variations des stationnements de limicoles indicatrices d'une perturbation générale en baie du Mont-Saint-Michel (France)]
p. 140-147


Reintroducing antelopes into arid areas: lessons learnt from the oryx in Saudi Arabia
[Réintroduire les antilopes en milieu aride : enseignements de l'oryx en Arabie Saoudite]
p. 158-165

Trends of a bitterling (Rhodeus sericeus) population in a man-made ditch network
[Évolution d'une population de bouvière (Rhodeus sericeus) dans un réseau de douves façonné par l'homme]
p. 166-173


Sustainable management of fixed dunes: example of a pilot site in Brittany (France)
[Gestion durable des dunes fixées : exemple d'un site pilote en Bretagne (France)]
p. 183-191

Beaver lodge location on the upstream Loire River
[Caractéristiques de l'habitat et localisation des gı̂tes de castors sur la Loire]
p. 192-199

Effect of habitat fragmentation on dispersal in the butterfly Proclossiana eunomia
[Effet de la fragmentation de l'habitat sur la dispersion chez le papillon Proclossiana eunomia]
p. 200-209

La Réunion and Mayotte cockroaches: impact of altitude and human activity
[Les blattes de La Réunion et Mayotte : impact de l'altitude et de l'anthropisation]
p. 210-216


Sommaire du Fascicule no. 1


Biologie et pathologie végétales / Vegetal biology and pathology
L'arsenal phytosanitaire face aux ennemis des plantes. Considérations générales
p. 1-7

Biologie et pathologie végétales / Plant biology and pathology
Modes d'action des produits phytosanitaires sur les organismes pathogènes des plantes
p. 9-21

Biologie et pathologie végétales / Plant biology and pathology
Apport de la biologie moléculaire et cellulaire et de la génétique à la protection des plantes
p. 23-35

Plant biology and pathology / Biologie et pathologie végétales
Agronomic approach: cropping systems and plant diseases
[Approche agronomique : systèmes de culture et maladies des plantes]
p. 37-46

Biologie et pathologie végétales / Plant biology and pathology
Mise en place de stratégies phytosanitaires
p. 47-49


Biological modelling / Biomodélisation
Networks as constrained thermodynamic systems
[Les réseaux : systèmes thermodynamiques contraints]
p. 65-74


Plant biology and pathology / Biologie et pathologie végétales
A chemotaxonomic method to quantify phytoplankton groups in freshwater lentic mesocosms: an approach including chlorophyll a breakdown products
[Une méthode chémotaxonomique pour la quantification des phytoplanctons en écosystème lentique : une approche incluant des produits de dégradation de la chlorophylle a]
p. 95-105


Evolution / Évolution
Dispersal and fighting in male pollinating fig wasps
[Combats et dispersion chez les mâles de pollinisateurs de Ficus]
p. 121-130

Sommaire du Fascicule no. 2



Biological modelling / Biomodélisation
What do we mean by biological complexity?
[Qu'entendons-nous par complexité biologique ?]
p. 133-140

Biological modelling / Biomodélisation
Does the size of small objects influence chemical reactivity in living systems?
[La taille des petits objets a-t-elle une influence sur la réactivité chimique dans les systèmes vivants ?]
p. 141-147

Biological modelling / Biomodélisation
Biological processes in organised media
[Processus biologiques en milieux structurés]
p. 149-159

Biological modelling / Biomodélisation
Actin-based motility as a self-organized system: mechanism and reconstitution in vitro
[Motilité actine-dépendante en tant que système auto-organisé : mécanisme et reconstitution in vitro]
p. 161-170

Biological modelling / Biomodélisation
Genetic regulation networks: circuits, regulons and attractors
[Réseaux de régulation génétique : circuits, régulons, attracteurs]
p. 171-188

Biological modelling / Biomodélisation
Stochastic models for circadian rhythms: effect of molecular noise on periodic and chaotic behaviour
[Modèles stochastiques pour les rythmes circadiens : effet du bruit moléculaire sur les comportements périodiques et chaotiques]
p. 189-203

Biological modelling / Biomodélisation
Emergence of complex behaviour from simple circuit structures
[Émergence de comportements complexes à partir de structures de circuits simples]
p. 205-214

Biological modelling / Biomodélisation
Hardware (DNA) circuits
[Circuits génétiques]
p. 215-217

Biological modelling / Biomodélisation
Separating objects and ‘neural’ computation
[Séparation des objets et calcul neuronal]
p. 219-222

Biological modelling / Biomodélisation
Complex pattern formation by a self-destabilization of established patterns: chemotactic orientation and phyllotaxis as examples
[Formation de motifs complexes par auto-déstabilisation de motifs préexistants : les exemples de l'orientation chémotactique et de la phyllotaxie]
p. 223-237

Biological modelling / Biomodélisation
On the mechanochemical theory of biological pattern formation with application to vasculogenesis
[Théorie mécanique de formation des motifs biologiques et application à la genèse des vaisseaux]
p. 239-252

Sommaire du Fascicule no. 3


Neurosciences
Cerebral metabolism and consciousness
[Métabolisme cérébral et conscience]
p. 253-273

Animal biology and pathology / Biologie et pathologie animales
Extrabuccal infralabial secretion outlets in Dromophis, Mimophis and Psammophis species (Serpentes, Colubridae, Psammophiini). A probable substitute for ‘self-rubbing’ and cloacal scent gland functions, and a cue for a taxonomic account
[Débouchés sécréteurs infralabiaux et extrabuccaux chez Dromophis, Mimophis et Psammophis sp. (Serpentes, Colubridae, Psammophiini). Substitution probable à des fonctions de « l'auto-frottement » et à celles des sacs cloacaux, ainsi que motif d'un compte-rendu taxinomique]
p. 275-286

Animal biology and pathology / Biologie et pathologie animales
Sense-organ-like parietal pits found in Psammophiini (Serpentes, Colubridae)
[Fossettes pariétales organoı̈des trouvées chez des Psammophiini (Serpentes, Colubridae)]
p. 287-293

Ecology / Écologie
Soil macroinvertebrates as indicators of pollution by heavy metals
[Les macroinvertébrés du sol en tant qu'indicateurs de pollution du sol par les métaux lourds]
p. 295-303

Ecology / Écologie
Spatio-temporal growth dynamics of a subAlpine Pinus uncinata stand in the French Alps
[Dynamique spatio-temporelle de la croissance d'un peuplement de pins à crochets dans les Alpes françaises]
p. 305-315

Ecology / Écologie
Factors influencing the toxicity of xenobiotics against larval mosquitoes
[Facteurs influençant la toxicité des xénobiotiques sur les larves de moustiques]
p. 317-327

Ethology / Éthologie
Potential for individual recognition in acoustic signals: a comparative study of two gulls with different nesting patterns
[Reconnaissance individuelle par signaux acoustiques : comparaison entre deux espèces de Laridæ différant par leur écologie de nidification]
p. 329-337

Genomics / Génomique
Short inverse complementary amino acid sequences generate protein complexity
[Les courts inverses complémentaires de séquences d'aminoacides participent à la complexité des protéines]
p. 339-348

Sommaire du Fascicule no. 4


Biological modelling
Simulation of carbon reserve dynamics in Microcystis and its influence on vertical migration with Yoyo model
[Modélisation de la dynamique des réserves carbonées chez Microcystis et son influence sur la migration verticale]
p. 349-361

Biochemistry
Specific perception of ergosterol by plant cells
[Perception spécifique de l'ergostérol par les cellules végétales]
p. 363-370

Physiology
Effect of a cranium-directed daily illumination cycle on the laying rhythm in Japanese quail
[Chez la caille japonaise, effet sur le rythme de ponte d'un cycle lumière/obscurité appliqué directement sur le crâne]
p. 371-376


Plant biology and pathology
Effect of organic and mineral fertilizers on N-use by wheat under different irrigation frequencies
[Effets de l'apport des résidus de blé et de l'azote minéral sur la culture de blé sous différentes fréquences d'irrigation]
p. 391-399


Ecology
Efficiency of particle retention and clearance rate in the polychaete Sabellaria alveolata L.
[Efficacité de rétention de particules et valeurs de filtration chez le polychète Sabellaria alveolata L]
p. 413-421

Taxinomy
Two new species of hydrothermal vent crabs of the genus Bythograea from the southern East Pacific Rise and from the Galapagos Rift (Crustacea Decapoda Brachyura Bythograeidae)
[Deux nouvelles espèces du crabe hydrothermal Bythograea originaires du sud de la dorsale du Pacifique oriental et de la ride des Galapagos (Crustacea Decapoda Brachyura Bythograeidae)]
p. 423-439


Anthropology
A comparison of taste thresholds for sweet and astringent-tasting compounds in great apes
[Une étude comparative des seuils gustatifs de substances sucrée et astringente chez les singes anthropoı̈des]
p. 449-455

Sommaire du Fascicule no. 5



Biological modelling / Biomodélisation
Modelling autocatalytic networks with artificial microbiology
[Modélisation de réseaux autocatalytiques à l'aide de la microbiologie artificielle]
p. 459-466

Biological modelling / Biomodélisation
Dynamin recruitment by clathrin coats: a physical step?
[Recrutement des dynamines par les puits recouverts de clathrines : une étape physique ?]
p. 467-476

Evolution / Évolution
Adaptive branching in Evolution and Epigenesis
[Ramification adaptative en évolution et épigénèse]
p. 477-485

Biological modelling / Biomodélisation
Bio-array images processing and genetic networks modelling
[Traitement d'images bio-array et modélisation de réseaux génétiques]
p. 487-500

Model-driven acquisition / Acquisition conduite par le modèle
Dynamic simulation of pollutant effects on the threonine pathway in Escherichia coli
[Simulation dynamique d'effets de pelluants sur la chaı̂ne de biosynthèse de la thréonine d'Escherichia coli]
p. 501-508

Biological modelling / Biomodélisation
Metabolic analysis in drug design
[L'analyse métabolique dans la conception des nouveaux médicaments]
p. 509-515

Biological modelling / Biomodélisation
Integrative biology: linking levels of organization
p. 517-522

Sommaire du Fascicule no. 6


The global allostery model of hemoglobin: an allosteric mechanism involving homotropic and heterotropic interactions
[Modèle de l'allostérie globale de l'hémoglobine : un mécanisme allostérique impliquant des interactions homotropes et hétérotropes]
p. 523-532

Interaction of nitrogen monoxide with hemoglobin and the artefactual production of S-nitroso-hemoglobin
[Interaction du monoxyde d'azote avec l'hémoglobine et la production artéfactuelle de 𝐒-nitroso-hémoglobine]
p. 533-541


Plant biology and pathology
Gravitational stress on germinating Pinus pinea seeds
[Le stress gravitationnel sur la germination des graines de Pinus pinea]
p. 553-564

Microbiology: Parasitology
The geographical segregation of human lice preceded that of Pediculus humanus capitis and Pediculus humanus humanus
[La ségrégation géographique du pou humain a précédé celle de Pediculus humanus capitis et de Pediculus humanus humanus]
p. 565-574

Ecology
Conservation and control strategies for the wolf (Canis lupus) in western Europe based on demographic models
[Stratégies de conservation et de contrôle du loup (Canis lupus) en Europe occidentale basées sur des modèles démographiques]
p. 575-587

Ecology
Video-logging for examining biogenic structures in deep heterogeneous subsurface sediments
[Utilisation de la vidéo-prospection pour examiner les structures biogènes dans les sédiments hétérogènes profonds]
p. 589-597

Evolution
Phylogenetic relationships within the fern genus Hymenophyllum s.l. (Hymenophyllaceae, Filicopsida): contribution of morphology and cytology
[Systématique du genre Hymenophyllum s.l. (Hymenophyllaceae, Filicopsida) : apport des données anatomo-morphologiques et cytologiques]
p. 599-611

Sommaire du Fascicule no. 7


Cell biology
Identification of new partners of the epithelial sodium channel alpha subunit
[Identification de nouveaux partenaires de la sous-unité alpha du canal à sodium]
p. 615-624

Neurosciences
A new way of analysing symmetrical and asymmetrical gaits in quadrupeds
[Une nouvelle méthode d'analyse des allures symétriques et asymétriques des quadrupèdes]
p. 625-630


Plant biology and pathology
Changes in antioxidant and lignifying enzyme activities in sunflower roots (Helianthus annuus L.) stressed with copper excess
[Variations des activités enzymatiques anti-oxydantes et lignifiantes dans les racines de tournesol (Helianthus annuus L.) traitées par un excès de cuivre]
p. 639-644


Pharmocologie, toxicologie
Le mécanisme de défense multixénobiotique (MDMX) chez les bivalves
p. 659-672

Medical sciences
Stem cells: ethics, legislation and regulation
p. 673-676

Ecology
Maternal food calling in domestic hens: influence of feeding context
[Le cri d'offrande alimentaire chez la poule maternelle : influence du contexte alimentaire]
p. 677-686

Evolution
Status of the so-called African pygmy elephant (Loxodonta pumilio (Noack 1906)): phylogeny of cytochrome b and mitochondrial control region sequences
[Statut de l'éléphant d'Afrique dit nain (Loxodonta pumilio (Noack 1906)) : phylogénie des séquences de cytochrome b et de la région de contrôle mitochondriale]
p. 687-697

Sommaire du Fascicule no. 8



Biological modelling
Pigmentation pattern formation in butterflies: experiments and models
[La formation des motifs de pigmentation des ailes des papillons : expériences et modèles]
p. 717-727



Ecology
Demographic and genetic structures of white sea bream populations (Diplodus sargus, Linnaeus, 1758) inside and outside a Mediterranean marine reserve
[Structures démographique et génétique des populations de sar commun (Diplodus sargus, Linnaeus, 1758) au sein et à l'extérieur d'une réserve marine en Méditerranée]
p. 751-760


Evolution
Genetic study of Coris julis (Osteichtyes, Perciformes, Labridae) evolutionary history and dispersal abilities
[Étude génétique des capacités de dispersion et de l'histoire évolutive de Coris julis (Linnaeus, 1758) (Osteichtyes, Perciformes, Labridae)]
p. 771-785

Sommaire du Fascicule no. 9



Neurosciences
Expression of SR–BI receptor and StAR protein in rat ocular tissues
[Expression des protéines SR–BI et StAR dans les tissus oculaires de rat]
p. 841-851

Sommaire du Fascicule no. 10-11


Molecular biology and genetics
Foreword: from the Transcriptome conferences to the Systemoscope International Consortium
[Des conférences Transcriptome au Consortium International Systemoscope]
p. 867-875

Molecular biology and genetics
From functional genomics to systems biology: concepts and practices
[De la génomique fonctionnelle à la biologie systémique : concepts et pratiques]
p. 879-892

Molecular biology and genetics
From the messenger RNA saga to the transcriptome era
[De la saga de l'ARN messager à l'ère du transcriptome]
p. 893-900

Molecular biology and genetics
Expanding genome capacity via RNA editing
[Expansion de la capacité du génome par l'édition d'ARN]
p. 901-908

Molecular biology and genetics
Transcriptomic analysis of the NCI-60 cancer cell lines
[Analyse du transcriptome dans les 60 lignées cellulaires de cancers du NCI]
p. 909-920

Molecular biology and genetics
The Riken mouse genome encyclopedia project
[Le projet d'encyclopédie du génome murin de Riken]
p. 923-929

Molecular biology and genetics
The NIA cDNA Project in mouse stem cells and early embryos
[Le projet ADNc du NIA sur les cellules souches et embryons précoces de souris]
p. 931-940

Molecular biology and genetics
Adaptor-tagged competitive PCR: study of the mammalian nervous system
[PCR compétitive avec adaptateur marqué : étude du système nerveux des mammifères]
p. 941-947

Molecular biology and genetics
Transcriptome study in China
p. 949-957

Molecular biology and genetics
The Kazusa cDNA project for identification of unknown human transcripts
[Le projet ADNc de Kazusa pour l'identification de transcrits humains inconnus]
p. 959-966

Molecular biology and genetics
LNCIB human full-length cDNAs collection: towards a better comprehension of the human transcriptome
[La collection d'ADNc complets du LNCIB pour l'étude du transcriptome humain]
p. 967-970

Molecular biology and genetics
Concatenation cDNA sequencing for transcriptome analysis
[Séquençage d'ADNc par concaténation pour l'analyse de transcriptomes]
p. 971-977


Molecular biology and genetics
Small open reading frames in 5′ untranslated regions of mRNAs
[Petites phases ouvertes de lecture dans les régions 5' non traduites d'ARNm]
p. 987-991

Molecular biology and genetics
High-throughput classification of images of cells transfected with cDNA clones
[Classification à haut débit d'images de cellules transfectées par des ADNc]
p. 993-1001

Molecular biology and genetics
cDNAs for functional genomics and proteomics: the German Consortium
[ADNc pour la génomique fonctionnelle et la protéomique : le consortium allemand]
p. 1003-1009

Molecular biology and genetics
In situ analysis of gene expression in Xenopus embryos
[Analyse in situ de l'expression des gènes dans les embryons de Xénope]
p. 1011-1017

Molecular biology and genetics
RNA amplification, fidelity and reproducibility of expression profiling
[Amplification d'ARN, fidélité et reproductibilité du profilage d'expression]
p. 1021-1030

Molecular biology and genetics
Gene expression profiling of breast carcinomas using Nylon DNA arrays
[Réseaux d'ADN sur Nylon et profils d'expression génique dans le cancer du sein]
p. 1031-1039

Molecular biology and genetics
Osteopontin identified as colon cancer tumor progression marker
[L'ostéopontine identifiée comme marqueur de la progression des cancers du côlon]
p. 1041-1043

Molecular biology and genetics
Regulation of dendritic cell subsets by NKT cells
[Régulation de sous-ensembles de cellules dendritiques par des cellules NKT]
p. 1045-1048

Molecular biology and genetics
In vivo filtering of in vitro expression data reveals MyoD targets
[Le filtrage in vivo de données d'expression in vitro révèle des cibles de MyoD]
p. 1049-1065

Molecular biology and genetics
GeneNote: whole genome expression profiles in normal human tissues
[GeneNote : profils d'expression complets dans des tissus humains normaux]
p. 1067-1072

p. 1075-1078

Molecular biology and genetics
CIBEX: Center for Information Biology gene EXpression database
[CIBEX : base de données d'expression génique du Centre d'information biologique]
p. 1079-1082

Molecular biology and genetics
Microarray analysis using bioinformatics analysis audit trails (BAATs)
[Analyse génomique comparative avec traçage audité de l'analyse bioinformatique]
p. 1083-1087

Molecular biology and genetics
Application of eVOC: controlled vocabularies for unifying gene expression data
[eVOC : vocabulaires contrôlés pour l'unification de données d'expression génique]
p. 1089-1096

Molecular biology and genetics
Zipf's law and human transcriptomes: an explanation with an evolutionary model
[Loi de Zipf et transcriptomes humains : explication avec un modèle évolutif]
p. 1097-1101

Molecular biology and genetics
The macro-ethics of genomics to health: the Physiome Project
[La macro-éthique, de la génomique à la santé : le projet Physiome]
p. 1105-1110

Molecular biology and genetics
Product patents on human DNA sequences: where do we stand in Europe?
[Brevets de produits sur les séquences d'ADN humaines : où en est-on en Europe ?]
p. 1111-1114

Molecular biology and genetics
Patenting genome research tools and the law
[Prise de brevet des outils de la recherche génomique et la loi]
p. 1115-1120

Molecular biology and genetics
The Universal Declaration on the Human Genome and Human Rights
[La Déclaration Universelle sur le Génome Humain et les Droits de l'Homme]
p. 1121-1125

Molecular biology and genetics
Patentability of life and ethics
[Brevetabilité du vivant et éthique]
p. 1127-1134

Sommaire du Fascicule no. 12



Animal biology and pathology / Biologie et pathologie animales
Humicolous buthoid scorpions: a new genus and species from French Guiana
[Scorpions Buthoidea humicoles : un nouveau genre et espèce de la Guyane française]
p. 1149-1155

p. 1157-1162

Biologie et pathologie végétales / Plant biology and pathology
Mécanismes de bioprotection des plantes de lentille par Rhizobium leguminosarum contre Fusarium oxysporum f. sp. lentis
p. 1163-1173

Evolution / Évolution
Replication of hexitol oligonucleotides as a prelude to the propagation of a third type of nucleic acid in vivo
[Réplication in vivo et ex vivo de l'analogue hexitol des acides nucléiques]
p. 1175-1184

Ethology / Éthologie
Vocal similarities and social bonds in Campbell's monkey (Cercopithecus campbelli)
[Similarités vocales et relations sociales chez la mone de Campbell (Cercopithecus campbelli)]
p. 1185-1193